南京农业大学正在积极承担的作物表型组学研究重大科技基础设施建设项目，已列入《国家重大科技基础设施建设“十三五”规划》。项目得到了教育部的全力支持，2019年2月，教育部和江苏省人民政府签署了教育部-江苏省人民政府共建设施协议，教育部投资1.44亿元建设作物表型组学研发大楼。江苏省也高度重视设施建设，将该项目列入2019年省委工作要点，南京市委市政府连续两年将该项目列入市级重大项目，会同省政府给予6000万元的培育经费。

设施建设内容包括：高通量表型数据采集与鉴定系统、环境模拟与检测系统、表型组-基因组大数据分析与整合系统等。建成后，具有从分子细胞到组织形态多层次、多生境和全生育期多尺度，对六种以上主要作物进行年百万株及日百亩大田表型精准采集与深度解析的能力。将成为开放、共享的国际一流作物基因资源研究平台、种质创新中心、生物种业人才培养中心和国际交流中心，引领世界作物科学研究和农业产业发展，保障我国粮食和种业安全。

目前，已建立了基因型到表型的全创新链研究体系；建成了室内外高通量表型设施等预研平台；组建了一支国际化队伍；

搭建了作物表型的国际国内平台；建立了一批国际联合研究中心；与Science签约合作创办《植物表型组学》英文期刊；构建了从本科生-研究生培养体系，人工智能专业（农业领域）获批为2018年度普通高等学校新增本科专业。