高通量测序系统
固定资产号:1107011S
规格型号:Hiseq2500
产地国别:美国
生产制造商:Illumina公司
仪器的详细技术指标:
1.高数据通量:每次仪器运行单端读取至少可生成3000亿碱基数据,双端读取至少可生成6000亿碱基数据
2.实验时间:单端读取4天,双端读取8天(根据测序长度略有变化)
3.运行成本:从样品制备到数据读取,每测量100万个碱基对所需成本不高于0.05美元
4.数据读长:单端读取序列,读长大于100个碱基;
5.双端读取序列:读长大于2x100个碱基
6.样品用量:DNA样本需要0.1-1微克gDNA或cDNA
7.读取精度:原始数据准确性≥98.5%,3倍覆盖拼接序列准确性≥99.99%
8.可精确读取≥10个的连续单个重复碱基(如AAAAAAAAAA),准确性≥98.5%
9.不同样品并行性:每次仪器运行可平行分析8个非混合的独立样品
仪器的主要功能:
1.未知物种基因组的从头测序
2.已经测序物种的基因组重新测序
3.扩增产物重测序
4.基因组尺度转录组学分析
5.基因表达谱及基因调控研究
6.全基因组小分子RNA(miRNA)分析
7.染色质免疫互沉淀研究
8.多重单核苷酸多型性
9.表观遗传学研究如甲基化、磷酸化修饰研究
10.蛋白-DNA相互作用研究
11.染色体重排研究(缺失,插入等等)
12.可进行全基因组测序、重测序、转录组测序、多位点SNP检测和遗传插入缺失等研究。